接受运输发票要注意以下四点：
首先，注意发票开票单位是否合法。开票单位必须是经税务机关批准，有自行开具运输发票资格的企业，或者是主管地方税务局以及经省级地方税务局批准委托的中介机构。其他单位代运输单位和个人开具的运输发票一律不得抵扣。
其次，自开票纳税人和代开票单位必须按照规定逐栏、如实填开货物运输业发票。凡开具给增值税一般纳税人的货物运输业发票，必须填写该增值税一般纳税人的名称和纳税人识别号。自开发票的，应在运费发票下方正中央加盖有开票人识别号、主管地方税务机关名称和代码等内容的“开票人专章”和财务专用章。
第三，申报抵扣增值税时的手续是否符合规定。取得的所有需计算抵扣增值税进项税额的运输发票，应根据相关运输发票逐票填写《增值税运输发票抵扣清单》，增值税一般纳税人必须填写其中的“取得运输发票单位名称及识别号”栏，否则，所取得的运费发票不能作为增值税进项抵扣凭证。在进行增值税纳税申报时，除按现行规定申报报表资料外，还必须报送《增值税运输发票抵扣清单》。纳税人除报送清单纸质资料外，还需同时报送《增值税运输发票抵扣清单》的电子信息。未单独报送《增值税运输发票抵扣清单》纸质资料及电子信息的，其运输发票进项税额不得抵扣。如果纳税人未按规定要求填写《增值税运输发票抵扣清单》或者填写内容不全的，该张运输发票不得计算抵扣进项税额。因此，纳税人必须特别注意，在录入《增值税运输发票抵扣清单》信息采集软件时应细心，如果某些地方输入错误，经税务机关与开具的电子信息比对不符，那么该笔运输发票的进项税额不得抵扣。
第四，申报抵扣增值税的时间是否符合规定。纳税人取得的2003年10月31日以后开具的运输发票，应当自开票之日起90天内向主管国税局申报抵扣，超过90天的不得予以抵扣。
